Отпадъчните води, произведени от фурфурал, принадлежат към сложни органични отпадъчни води, които съдържат оцетна киселина, фурфурал и алкохоли, алдехиди, кетони, естери, органични киселини и много видове органични вещества, PH е 2-3, висока концентрация на COD и лоша биоразградимост .